土庫國中的校歌，由第一任的已故校長王梁甫先生作詞，校外的音樂工作者劉澤洋先生作曲，並由陳家湖老師長子陳茂萱教授配和聲。（北港文化中心家湖音樂廳的命名，就是為了紀念陳家湖老師。）
校歌歌詞最後一句，原本是「開創三民主義世紀，建設大中華」，但從第45屆（2015年楊善淵校長任內畢業）畢業紀念冊起，改成了現行的「展現允文允武才能，貢獻我家鄉」。
歌詞還有另外一處微小的更動：原先第三句「德智體群美五育並進」是「德智體群，四育並進」，自1982年第12屆畢業紀念冊才改為現今版本。
不過，以上看法從畢業紀念冊推論歌詞更動，有其限制。畢業紀念冊上的歌詞，可能根本只是套用前一年的印版而未更新。該年畢業紀念冊歌詞變動，不代表實際上就是在該年變動。如果真的要探究何時更改歌詞，或許要去查看以前的校務會議紀錄，因為這種重大事項，應該會開會討論才是。
下面列出各次修正的歌詞，修改之處以粗體表示。
最初版本歌詞（依據第1屆畢冊）
土庫國中，文化搖籃
莘莘學子，文武雙全
德智體群，四育並進
身心首腦皆臻至善
立志向上，愛國自強
崇禮尚義為人榜樣
啟發潛能，科學昌明
開創三民主義世紀，建設大中華
第12屆畢冊以後版本
土庫國中，文化搖籃
莘莘學子，文武雙全
德智體群美，五育並進
身心首腦皆臻至善
立志向上，愛國自強
崇禮尚義為人榜樣
啟發潛能，科學昌明
開創三民主義世紀，建設大中華
第45屆畢冊以後，現行版本
土庫國中，文化搖籃
莘莘學子，文武雙全
德智體群美，五育並進
身心首腦皆臻至善
立志向上，愛國自強
崇禮尚義為人榜樣
啟發潛能，科學昌明
展現允文允武才能，貢獻我家鄉